生命科学研究
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生命科学研究
2018年 22卷 5期
刊出日期：2018-10-31
研究论文
综述
研究论文
345
王晓阳，张乐宵，张 珂，李欣欣，苏琬真，张笑添，刘 威
共生乳酸乳球菌加速黑腹果蝇发育
为了从果蝇肠道内分离乳酸乳球菌，并研究它对宿主发育历期的影响，用
MRS
培养基从果蝇肠道内分离细菌，并经
16S rRNA
基因序列比对确定菌种；随后，检测果蝇的发育历期和生长速率。其中，免疫荧光染色和实时定量
PCR
分别用于检测肠道细胞增殖和促胸腺激素与胰岛素通路的激活；葡萄糖氧化酶法用于检测葡萄糖浓度。结果显示，从果蝇体内分离到一株乳酸乳球菌，该菌可以在果蝇肠道内有效定植，并通过生长速率促进果蝇的发育历期。
在细胞水平上
，乳酸乳球菌相关果蝇肠道内有丝分裂细胞约是无菌果蝇的
6
倍。在分子水平上，乳酸乳球菌激活荷尔蒙和胰岛素信号以刺激机体全身性增长。综上所述，乳酸乳球菌是果蝇的共生菌，可以通过荷尔蒙和胰岛素信号刺激果蝇的生长和发育。
2018 Vol. 22 (5): 345-354 [
摘要
] (
558
) [
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382KB] (
1912
)
355
张建英，贾 龙，张 化
正交实验优选沟眶象甲壳素的超声波提取工艺
以
沟眶象
干粉为原材料，通过单因素实验和正交实验优化了沟眶象甲壳素的超声波辅助酸碱法提取工艺。在不同条件下，研究超声处理的时间、功率、温度以及柠檬酸、氢氧化钠的浓度和固液比对甲壳素提取的影响，确定了沟眶象甲壳素的最佳提取工艺条件：氢氧化钠质量分数
9%
、固液比
1
︰
16
、温度
65
℃、时间
50 min
、
超声功率
60%
；柠檬酸浓度
1.8 g/L
、时间
25 min
、固液比
1
︰
12
、室温、超声功率
100%
。在此工艺条件下得到的甲壳素样品得率为
16.50 %
，比传统酸碱法提取甲壳素的得率减少
2.69%
，
但优化后的超声波辅助酸碱法所用时间仅占传统酸碱法的
4.31%
，因此超声波辅助酸碱法具有明显的优势。
2018 Vol. 22 (5): 355-362 [
摘要
] (
505
) [
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368KB] (
1857
)
363
景新星，宋佳坤，范纯新
母源性长链非编码RNA
Six
2
a-OT
参与斑马鱼胚胎发育调控
Six
基因家族进化高度保守，在脊椎动物个体发育中起着重要作用。但目前对其调控机制尚不完全清楚。在
UCSC (The University of California Santa Cruz) Genome Browser
的斑马鱼基因组数据库中发现，
Six
2
a-Six
3
a
基因簇周围存在一条长链非编码RNA——
Six
2
a-OT
。首先，利用
反转录
PCR (RT-PCR)
结合测序证实了该RNA确实存在。然后，利用
荧光半定量
PCR (qPCR)
和
整胚原位杂交
(whole-mount
in situ
hybridization, WISH)确定了其特异性的表达模式：
Six
2
a-OT
在卵巢中的表达远高于精巢；在受精卵和早期原肠胚中高表达，随后显著下降；受精后
48 h (48 hpf)
集中表达于
耳囊
(otic vesicle)、躯干中线(trunk midline)和鳃弓(branchial archs)
。进一步利用反义吗啡啉(morpholino)特异性阻断
Six
2
a-OT
剪接，观察到63%的48 hpf胚胎表现出躯干变短、侧弯，或心包积水，同时
Six
2
a
和
Six
3
a
的表达显著下降。以上结果表明：
Six
2
a-OT
作为母源性因子通过调节
Six
2
a
和
Six
3
a
的表达参与斑马鱼胚胎早期发育。这为揭示
Six
基因簇的表达调控机制提供了重要依据。
2018 Vol. 22 (5): 363-369 [
摘要
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655
) [
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504KB] (
2239
)
370
杨少丽，秦松
Gateway技术构建菊芋块茎全长cDNA文库及EST测序分析
为丰富菊芋功能基因组学研究基础平台，以成熟期菊芋块茎为材料，将菊芋全长cDNA与Gateway供体载体pDONR222重组，构建了菊芋非剪切型全长cDNA文库。文库质量分析表明：未经扩增的原始文库库容量为5.76×10
6
cfu，插入片段大小主要为1~3 000 bp，重组率为100% (24/24)，达到了高质量文库的标准。利用该文库进行表达序列标签(expressed sequence tag, EST)测序，得到2 639条高质量的EST序列，拼接后获得1 895条非重复的唯一表达序列(unigene)。与NCBI的NR数据库同源比对分析表明，共有1 533条unigene (80.9%)与已知基因有显著的同源性。GO分类结果显示：菊芋块茎表达基因在分子功能类群中，结合和催化活性所占比例最高。此cDNA文库将可用于菊芋功能基因组研究、新基因筛选、高通量EST测序以及菊芋cDNA芯片的制备等。
2018 Vol. 22 (5): 370-374 [
摘要
] (
645
) [
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1038KB] (
2058
)
375
刘 钊，石胜超，舒 服，柳 勇，王 璐，邓学建
湖南省两栖类新纪录——龙胜臭蛙
2013
年
8
月在湖南省黄桑国家级自然保护区发现龙胜臭蛙
(Odorrana lungshengensis)
，原有文献记录湖南省存在龙胜臭蛙实为宜章臭蛙
(Odorrana yizhangensis)
。本次在黄桑国家级自然保护区发现的物种为湖南省新纪录。目前标本保存于湖南师范大学生命科学学院脊椎动物实验室。
2018 Vol. 22 (5): 375-376 [
摘要
] (
657
) [
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815KB] (
2158
)
377
许国栋，王长义，孔凡倩，李雯霞，胡景岑，应秀茹，段世伟，韩丽媛
高血压患者
CBS
基因启动子低甲基化增加缺血性脑卒中的风险
通过比较高血压患者与并发缺血性脑卒中的高血压患者的胱硫醚
β
合成酶
(
cystathionine beta- synthase, CBS
)
基因启动子区域甲基化率，探讨
CBS
基因启动子甲基化与脑卒中的关系。选取
243
名高血压患者
(
高血压组
)
和
132
名高血压并发缺血性脑卒中患者
(
脑卒中组
)
，采用甲基化特异性实时定量聚合酶链反应技术检测
CBS
基因启动子区域甲基化率。结果发现：脑卒中组的同型半胱氨酸为
21.13±18.56 μmol/L
，高于高血压组的
16.97±12.89 μmol/L (
P
=0.01)
；脑卒中组甲基化率为
38.05%
，低于高血压组的
50.61% (
P
<0.01)
。在校正多种危险因素后，与最低三分位数
(Q1)
相比，
CBS
甲基化最高三分位数
(Q3)
与脑卒中的优势比
(
odds ratio
, OR)
在总人群、男性、女性中分别为
0.26 (95% CI: 0.14~0.47)
、
0.14 (95% CI: 0.06~0.36)
、
0.48 (95% CI: 0.19~1.20)
。
CBS
甲基化率每增加
5%
对脑卒中的
OR (95% CI)
在总人群、男性、女性中分别为
0.91 (0.86~0.95)
、
0.87 (0.81~0.93)
、
0.93 (0.86~0.99)
。此外，男性高血压患者中
CBS
甲基化率与缺血性脑卒中的受试者工作特征曲线下的面积为
0.69 (95% CI: 0.62~0.76)
。以上结果初步表明脑卒中患者中
CBS
基因启动子呈低甲基化状态，且高血压人群中
CBS
低甲基化增加脑卒中的发病风险。
2018 Vol. 22 (5): 377-383 [
摘要
] (
772
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540KB] (
1840
)
384
解琪琪，李文洲，史卫东，邓亚军，任恩惠，马靖琳，康学文，汪 静
SNI大鼠模型诱发的早期病理性疼痛相关基因芯片数据的生物信息学分析
为了探讨
坐骨神经分支选择性结扎
(spared nerve injury, SNI)
诱发的神经病理性疼痛早期的基因表达和生物学过程的改变
，为神经病理性疼痛分子机制的进一步研究提供生物信息学依据，从
GEO
数据库下载
已有文献
构建的
SNI
早期大鼠模型的基因芯片数据集，应用生物信息学方法筛选差异表达基因，并利用
DAVID
进行基因本体论
(Gene Ontology, GO)
及通路富集分析，然后通过
STRING
数据库分析蛋白质互作网络的中心节点蛋白质。应用生物信息学方法对
SNI
芯片数据重新进行挖掘，从基因水平探讨
SNI
模型大鼠诱发的早期神经病理性疼痛发生发展的分子机制，可为
SNI
诱发早期神经病理性疼痛的发生及维持期的分子机制研究提供参考和依据。分析结果显示细胞外基质和离子通道活性的改变对
SNI
诱发大鼠早期神经病理性疼痛的发生发展起着关键性的作用，表明细胞外基质受体交互通路和
MAPK
通路与
SNI
诱发大鼠早期神经病理性疼痛密切相关，相关的分子机制值得进一步深入研究。
2018 Vol. 22 (5): 384-389 [
摘要
] (
791
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694KB] (
1880
)
390
莫艳秀，陈淑娟，范云鹏，李木兰，张 鹏，刘文彬，肖亚梅
顺铂作用于人恶性睾丸生殖细胞瘤NT2细胞后对肿瘤干细胞标志物的影响
为了探讨顺铂
(cisplatin
，
CDDP)
对人恶性睾丸生殖细胞瘤
NT2
细胞中干细胞标志物的影响，用
20 μmol/L CDDP
作用于处于对数生长期的
NT2
细胞
12 h
、
24 h
、
48 h
，采用免疫荧光、实时定量
PCR
和
Western-blot
法检测
NT2
细胞中干细胞标志物
Sox-2
、
Oct-4
、
Nanog
的细胞定位以及
mRNA
和蛋白质的表达情况，同时对肿瘤干细胞耐药相关基因
ABCG
2
的表达进行实时定量
PCR
检测。与对照组相比，
CDDP
处理组细胞变圆且漂浮细胞数量增多，存留活细胞数量随药物作用时长增加而减少；免疫荧光显示
Sox-2
、
Oct-4
、
Nanog
主要定位在细胞质中；实时定量
PCR
和
Western-blot
分析结果都显示
Sox-2
、
Oct-4
、
Nanog
在
CDDP
处理组中的表达较对照组上调；同时
ABCG
2 mRNA
的相对表达量在
CDDP
处理组显著增加
(
P
<0.05)
。研究结果初步表明，顺铂导致人恶性睾丸生殖细胞瘤
NT2
细胞的肿瘤干细胞耐药机制加强。
2018 Vol. 22 (5): 390-396 [
摘要
] (
647
) [
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2073
)
综述
397
胡绍杰，蒋莎莎，张 瑾，于 博，罗 丹，杨良燕，衷画画，洪芬芳，杨树龙
细胞凋亡在肝脏衰老中的作用
细胞凋亡是细胞的一种程序性死亡过程，存在死亡受体主导的外源性凋亡途径和细胞器触发的内源性凋亡途径。细胞凋亡主要清除异常细胞以保证机体的正常生理功能，其作用与凋亡程度有关。肝脏衰老是一种随年龄增长的自然进程，通常伴随着肝脏合成与分解代谢等功能的降低。肝脏的高强度代谢活动使其容易受到外源性和内源性的应激刺激，进而激活肝脏细胞
p
53
等基因，通过相关的信号通路发生自噬、细胞周期阻滞和
DNA
修复等，最终细胞可能清除应激，也可能因
DNA
损伤导致衰老、凋亡甚至癌变。其中细胞凋亡和衰老在肝脏中有保护与损害双重作用。一方面，凋亡和衰老可使细胞避免癌变；另一方面，凋亡可加剧因衰老造成的肝脏功能减退，而且凋亡失衡时可能导致非酒精性脂肪肝疾病、肝纤维化、肝硬化、肝癌等肝脏衰老相关的疾病。本文就近年来有关细胞凋亡在肝脏衰老期间可能存在的保护、损害作用以及在老年性肝病发生机制中的作用进行了分析和总结。
2018 Vol. 22 (5): 397-405 [
摘要
] (
895
) [
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346KB] (
2880
)
406
欧阳灿，黄 慧，唐 芳，周 征
参与DNA损伤应答的长链非编码RNA
长链非编码
RNA (long non-coding RNA
，
lncRNA)
曾被看成是转录“噪声”，事实上它在多种生命过程中发挥重要作用，其中就包括
DNA
损伤应答
(DNA damage response
，
DDR)
。
DDR
是细胞维持基因组稳定性的基石，它的缺陷会导致包括癌症在内的多种疾病的发生与发展。
近年有关
lncRNA
在
DDR
中作用的研究发现，
lncRNA
不仅参与
DDR
，而且在
DDR
多个环节中发挥重要作用。
DNA
损伤发生后，细胞内许多
lncRNA
的转录发生显著变化，其中一些
lncRNA
的转录变化就是
DDR
调控的结果，如
lincRNA-p
21
等。现有研究显示，这些由
DNA
损伤胁迫引起转录变化的
lncRNA
，可以通过调控
DDR
功能因子转录、参与
DDR
信号传导和直接参与
DNA
损伤修复这
3
种方式参与
DDR
，另有一些可受激转录的
lncRNA
则参与维护染色体整倍性和完整的基因组稳定机制，如
NORAD
和
TERRA
。
2018 Vol. 22 (5): 406-411 [
摘要
] (
598
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330KB] (
1914
)
412
原壮壮，黄 皓，杨一峰，谭志平
纤毛与人体左右不对称发育研究进展
人体内脏器官在位置及形态上呈左右不对称分布。纤毛在左右不对称发育中发挥关键作用。目前已鉴定数十个不对称发育相关的人类疾病基因，这些基因大多涉及纤毛发生、运动以及Nodal-Pitx2信号传导过程。文中主要介绍了纤毛影响Nodal-Pitx2信号通路导致人体左右不对称发育的过程。此外还简要阐述了纤毛与先天性心脏病的关系以及左右不对称发育人类遗传学研究的最新发现。这些进展将有助于我们深入了解左右不对称发育分子机制以及纤毛与人类疾病的联系。
2018 Vol. 22 (5): 412-421 [
摘要
] (
518
) [
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1KB] [
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484KB] (
2411
)
422
翁新宪，周 转，张治宝，廖朝亮，杨力芳
外泌体形成分泌调控及其在肿瘤发生发展中的作用
外泌体
(
exosome
)
是起源于细胞内体的双层膜小泡。作为细胞间重要的介质，外泌体转运脂质、蛋白质、
RNA
等物质，从而发挥重要的生物学功能。外泌体的形成与分泌需要经过一个多因素、多阶段参与的精细调控过程，供体细胞分泌负载内含物的外泌体进入肿瘤微环境，经受体细胞以不同的作用方式摄取其中的内含物，从而促进肿瘤的侵袭转移、免疫逃逸、治疗抵抗等。近年来，外泌体已成为医学研究的热点之一。现就外泌体形成分泌调控及其在肿瘤发生发展中的作用进展予以综述。
2018 Vol. 22 (5): 422-430 [
摘要
] (
791
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523KB] (
3329
)
生命科学研究
编辑部公告
·
《生命科学研究》生态学专栏征稿启事
·
《生命科学研究》“高校教改研究与实践”栏目征稿启事
·
《生命科学研究》“新冠肺炎专栏”征稿启事
·
关于《生命科学研究》编辑部免收审稿费的通知
·
关于近期《生命科学研究》采编系统无法打开的说明
·
《生命科学研究》被评为2016年度“中国高校优秀科技期刊”
·
关于本刊对外联络邮箱调整的重要公告
·
《生命科学研究》征稿征订启事
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