仝 莉, 王茂春, 李 雨, 李 凯, 周宇荀, 肖君华, 金 力
生命科学研究. 2016, 20(4): 296-300.
摘 要: 利用荧光PCR技术对Crispr/Cas9系统敲除的microRNA 505小鼠进行鉴定, 能快速检测出敲除小鼠的基因型, 有效加快敲除小鼠基因功能验证的进程。首先, 在Crispr/Cas9系统敲除的基因位点区域设计PCR引物, 并在上游引物的5′端使用羟基荧光素(5-carboxyfluorescein, FAM)荧光修饰。模板经过PCR的扩增后, 将PCR产物与已知片段大小的6-羧基-X-罗丹明琥珀酰亚胺酯(6-carboxy-X-rhodamine, ROX)混合, 在377测序仪上通过聚丙烯酰胺凝胶电泳分离。随后, 根据相对分子质量内标法计算出PCR产物大小, 从而达到鉴定小鼠基因型的目的。将上述荧光PCR技术应用于实践发现, 两只奠基鼠、16只F1代小鼠以及26只F2代小鼠都能得到准确的鉴定, 其中包括microRNA 505基因区段被敲除了17 bp和23 bp。因此, 利用荧光PCR技术可以快速、准确地鉴定Crispr/Cas9敲除小鼠。