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| SNI大鼠模型诱发的早期病理性疼痛相关基因芯片数据的生物信息学分析 |
| 李文洲1, 2, 3，史卫东1, 2, 3，邓亚军1, 2, 3，任恩惠1, 2, 3，马靖琳3，康学文1，汪 静1, 3 |
| 1. 兰州大学第二医院骨科；2. 兰州大学；3. 甘肃省骨关节疾病研究重点实验室 |
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| Bioinformatics Analysis of Gene Chip Data Related to Induced Early Pathological Pain in SNI Rat Model |
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摘要 为了探讨坐骨神经分支选择性结扎(spared nerve injury, SNI)诱发的神经病理性疼痛早期的基因表达和生物学过程的改变，为神经病理性疼痛分子机制的进一步研究提供生物信息学依据，从GEO数据库下载已有文献构建的SNI早期大鼠模型的基因芯片数据集，应用生物信息学方法筛选差异表达基因，并利用DAVID进行基因本体论(Gene Ontology, GO)及通路富集分析，然后通过STRING数据库分析蛋白质互作网络的中心节点蛋白质。应用生物信息学方法对SNI芯片数据重新进行挖掘，从基因水平探讨SNI模型大鼠诱发的早期神经病理性疼痛发生发展的分子机制，可为SNI诱发早期神经病理性疼痛的发生及维持期的分子机制研究提供参考和依据。分析结果显示细胞外基质和离子通道活性的改变对SNI诱发大鼠早期神经病理性疼痛的发生发展起着关键性的作用，表明细胞外基质受体交互通路和MAPK通路与SNI诱发大鼠早期神经病理性疼痛密切相关，相关的分子机制值得进一步深入研究。
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| 关键词 ：
SNI大鼠模型,
神经病理性疼痛,
差异表达基因,
生物信息学
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2018, Vol. 22 
